MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010159	CTG	2	6	305	310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418840
2	NC_010159	TTG	2	6	387	392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418840
3	NC_010159	AACC	2	8	443	450	50 %	0 %	0 %	50 %	162418840
4	NC_010159	TGT	2	6	484	489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418840
5	NC_010159	TAA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418840
6	NC_010159	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418840
7	NC_010159	TCA	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418440
8	NC_010159	TTG	2	6	885	890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418440
9	NC_010159	CTG	2	6	899	904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418440
10	NC_010159	TAA	2	6	934	939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418440
11	NC_010159	GTG	2	6	957	962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418440
12	NC_010159	CTT	2	6	979	984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418440
13	NC_010159	T	6	6	998	1003	0 %	100 %	0 %	0 %	162418440
14	NC_010159	AGC	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418440
15	NC_010159	CGT	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418440
16	NC_010159	GTT	2	6	1072	1077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418440
17	NC_010159	GTGC	2	8	1194	1201	0 %	25 %	50 %	25 %	162418440
18	NC_010159	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418440
19	NC_010159	A	6	6	1437	1442	100 %	0 %	0 %	0 %	162419901
20	NC_010159	ACA	3	9	1457	1465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419901
21	NC_010159	CAA	2	6	1506	1511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419901
22	NC_010159	CATT	2	8	1644	1651	25 %	50 %	0 %	25 %	162419901
23	NC_010159	ATTC	2	8	1758	1765	25 %	50 %	0 %	25 %	162419901
24	NC_010159	GCG	2	6	1878	1883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419901
25	NC_010159	TGG	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419901
26	NC_010159	ATG	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419901
27	NC_010159	ATG	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419901
28	NC_010159	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419901
29	NC_010159	TCT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419901
30	NC_010159	ATCA	2	8	2269	2276	50 %	25 %	0 %	25 %	162419901
31	NC_010159	TGC	2	6	2344	2349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419901
32	NC_010159	ACA	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419901
33	NC_010159	CTG	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419901
34	NC_010159	GCG	2	6	2537	2542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419510
35	NC_010159	TGG	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419510
36	NC_010159	CTG	3	9	2657	2665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419510
37	NC_010159	TTTA	2	8	2762	2769	25 %	75 %	0 %	0 %	162419510
38	NC_010159	GCC	2	6	2787	2792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419510
39	NC_010159	ACC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419510
40	NC_010159	GTTG	2	8	2815	2822	0 %	50 %	50 %	0 %	162419510
41	NC_010159	ATT	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419510
42	NC_010159	ATG	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419510
43	NC_010159	GCG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419510
44	NC_010159	TCA	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419510
45	NC_010159	T	6	6	3067	3072	0 %	100 %	0 %	0 %	162419510
46	NC_010159	GCG	2	6	3125	3130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419510
47	NC_010159	ACTC	2	8	3148	3155	25 %	25 %	0 %	50 %	162419510
48	NC_010159	AAT	2	6	3183	3188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419510
49	NC_010159	TGA	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419510
50	NC_010159	CCT	2	6	3223	3228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162419510
51	NC_010159	CTGG	2	8	3241	3248	0 %	25 %	50 %	25 %	162419510
52	NC_010159	GCA	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419510
53	NC_010159	TGG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419510
54	NC_010159	CAC	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419510
55	NC_010159	AAC	2	6	3534	3539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419510
56	NC_010159	TGA	3	9	3540	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419510
57	NC_010159	T	6	6	3627	3632	0 %	100 %	0 %	0 %	162419510
58	NC_010159	TCC	2	6	3741	3746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162419510
59	NC_010159	ATTC	2	8	3772	3779	25 %	50 %	0 %	25 %	162419510
60	NC_010159	GTT	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419510
61	NC_010159	A	8	8	3884	3891	100 %	0 %	0 %	0 %	162419510
62	NC_010159	TGC	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419510
63	NC_010159	ACC	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419510
64	NC_010159	CAG	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419510
65	NC_010159	TGT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419989
66	NC_010159	GTT	2	6	4030	4035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419989
67	NC_010159	TTG	2	6	4046	4051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419989
68	NC_010159	CCA	2	6	4066	4071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419989
69	NC_010159	GCCA	2	8	4098	4105	25 %	0 %	25 %	50 %	162419989
70	NC_010159	GAT	2	6	4107	4112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419989
71	NC_010159	TAAA	2	8	4117	4124	75 %	25 %	0 %	0 %	162419989
72	NC_010159	GTT	2	6	4153	4158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419989
73	NC_010159	CAG	3	9	4190	4198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419989
74	NC_010159	TGG	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419989
75	NC_010159	TGGC	2	8	4247	4254	0 %	25 %	50 %	25 %	162419989
76	NC_010159	ATC	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419989
77	NC_010159	GAT	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419989
78	NC_010159	CTGT	2	8	4455	4462	0 %	50 %	25 %	25 %	162419989
79	NC_010159	AGTG	2	8	4523	4530	25 %	25 %	50 %	0 %	162419989
80	NC_010159	TGG	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419989
81	NC_010159	TGC	2	6	4545	4550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419989
82	NC_010159	TAA	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419989
83	NC_010159	CAA	2	6	4628	4633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419989
84	NC_010159	TCA	2	6	4722	4727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419989
85	NC_010159	GAA	2	6	4736	4741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419989
86	NC_010159	GTA	2	6	4753	4758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419989
87	NC_010159	CTT	2	6	4769	4774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419989
88	NC_010159	GCG	2	6	4778	4783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419989
89	NC_010159	GT	3	6	4800	4805	0 %	50 %	50 %	0 %	162419989
90	NC_010159	TCAA	2	8	4875	4882	50 %	25 %	0 %	25 %	162419989
91	NC_010159	TGG	2	6	4893	4898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419989
92	NC_010159	TTC	2	6	4901	4906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419989
93	NC_010159	CTG	2	6	4956	4961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419989
94	NC_010159	CAG	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419989
95	NC_010159	GCT	2	6	5045	5050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419989
96	NC_010159	CTT	3	9	5251	5259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419989
97	NC_010159	TCA	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419989
98	NC_010159	GCG	2	6	5360	5365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419989
99	NC_010159	GGA	2	6	5391	5396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162419989
100	NC_010159	TGC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419989
101	NC_010159	TTCT	2	8	5503	5510	0 %	75 %	0 %	25 %	162419989
102	NC_010159	GAT	2	6	5520	5525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419989
103	NC_010159	GA	3	6	5902	5907	50 %	0 %	50 %	0 %	162419440
104	NC_010159	T	6	6	5959	5964	0 %	100 %	0 %	0 %	162419440
105	NC_010159	GTC	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419440
106	NC_010159	AGG	2	6	6046	6051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162419440
107	NC_010159	TGG	2	6	6111	6116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419440
108	NC_010159	TGG	2	6	6130	6135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419440
109	NC_010159	CTT	2	6	6139	6144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419440
110	NC_010159	CGC	2	6	6208	6213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419440
111	NC_010159	TAT	2	6	6367	6372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
112	NC_010159	T	6	6	6422	6427	0 %	100 %	0 %	0 %	162419440
113	NC_010159	T	6	6	6449	6454	0 %	100 %	0 %	0 %	162419440
114	NC_010159	CGT	2	6	6564	6569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419440
115	NC_010159	ATT	2	6	6579	6584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
116	NC_010159	TTA	2	6	6599	6604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
117	NC_010159	CTT	2	6	6634	6639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419440
118	NC_010159	ACC	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419440
119	NC_010159	ATT	2	6	6782	6787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
120	NC_010159	AT	4	8	6815	6822	50 %	50 %	0 %	0 %	162419440
121	NC_010159	GGT	2	6	6853	6858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419440
122	NC_010159	GGC	3	9	6895	6903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419440
123	NC_010159	TCG	2	6	6993	6998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419440
124	NC_010159	TTG	2	6	7016	7021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419440
125	NC_010159	ATT	2	6	7060	7065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
126	NC_010159	GTTG	2	8	7074	7081	0 %	50 %	50 %	0 %	162419440
127	NC_010159	TAT	3	9	7108	7116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
128	NC_010159	ACC	2	6	7118	7123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419440
129	NC_010159	GAT	2	6	7186	7191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419440
130	NC_010159	CGG	2	6	7233	7238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419440
131	NC_010159	AATG	2	8	7255	7262	50 %	25 %	25 %	0 %	162419440
132	NC_010159	ATT	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
133	NC_010159	GTGTT	2	10	7317	7326	0 %	60 %	40 %	0 %	162419440
134	NC_010159	GGT	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419440
135	NC_010159	GAT	2	6	7495	7500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419440
136	NC_010159	CGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419440
137	NC_010159	TTAT	2	8	7577	7584	25 %	75 %	0 %	0 %	162419440
138	NC_010159	CCCA	2	8	7630	7637	25 %	0 %	0 %	75 %	162419440
139	NC_010159	A	6	6	7883	7888	100 %	0 %	0 %	0 %	162420591
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142	NC_010159	AAT	2	6	8105	8110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420591
143	NC_010159	TGC	2	6	8136	8141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420591
144	NC_010159	CA	3	6	8143	8148	50 %	0 %	0 %	50 %	162420591
145	NC_010159	TGG	2	6	8366	8371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420036
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148	NC_010159	TG	3	6	8533	8538	0 %	50 %	50 %	0 %	162420036
149	NC_010159	GAT	2	6	8545	8550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420036
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152	NC_010159	CGC	2	6	8777	8782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420036
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154	NC_010159	CCCG	2	8	8851	8858	0 %	0 %	25 %	75 %	162420036
155	NC_010159	ATT	2	6	8874	8879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420036
156	NC_010159	GAT	3	9	8950	8958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420036
157	NC_010159	AGC	2	6	8967	8972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420036
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162	NC_010159	TTA	2	6	9139	9144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420036
163	NC_010159	CGG	2	6	9188	9193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420036
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166	NC_010159	ATT	2	6	9502	9507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421578
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168	NC_010159	GAT	2	6	9593	9598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421578
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170	NC_010159	TTG	2	6	9724	9729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421578
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229	NC_010159	GTT	2	6	19045	19050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420022
230	NC_010159	A	7	7	19074	19080	100 %	0 %	0 %	0 %	162420022
231	NC_010159	TAT	2	6	19125	19130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420022
232	NC_010159	CGT	2	6	19309	19314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420544
233	NC_010159	ATTG	2	8	19408	19415	25 %	50 %	25 %	0 %	162420544
234	NC_010159	TGT	2	6	19499	19504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420544
235	NC_010159	TAA	2	6	19684	19689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420544
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238	NC_010159	CTCTT	2	10	19760	19769	0 %	60 %	0 %	40 %	162420544
239	NC_010159	CTG	2	6	19790	19795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420127
240	NC_010159	TCA	2	6	19960	19965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420127
241	NC_010159	T	6	6	19992	19997	0 %	100 %	0 %	0 %	162420127
242	NC_010159	GCAT	2	8	20092	20099	25 %	25 %	25 %	25 %	162420127
243	NC_010159	TA	3	6	20162	20167	50 %	50 %	0 %	0 %	162420127
244	NC_010159	TCAC	2	8	20200	20207	25 %	25 %	0 %	50 %	162420127
245	NC_010159	ATTG	2	8	20516	20523	25 %	50 %	25 %	0 %	162421614
246	NC_010159	GCA	2	6	20543	20548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421614
247	NC_010159	GGC	2	6	20588	20593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421614
248	NC_010159	TATC	2	8	20642	20649	25 %	50 %	0 %	25 %	162421614
249	NC_010159	A	6	6	20697	20702	100 %	0 %	0 %	0 %	162421614
250	NC_010159	GAA	2	6	20709	20714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421614
251	NC_010159	ATT	2	6	20748	20753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421614
252	NC_010159	AAC	2	6	20856	20861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421169
253	NC_010159	CCTGA	2	10	20889	20898	20 %	20 %	20 %	40 %	162421169
254	NC_010159	AG	3	6	20993	20998	50 %	0 %	50 %	0 %	162421169
255	NC_010159	AGT	2	6	21039	21044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421169
256	NC_010159	TTC	2	6	21156	21161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421169
257	NC_010159	TGG	2	6	21179	21184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421169
258	NC_010159	GCCC	2	8	21279	21286	0 %	0 %	25 %	75 %	162421169
259	NC_010159	AGA	2	6	21299	21304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421169
260	NC_010159	AAC	2	6	21358	21363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421169
261	NC_010159	GAT	2	6	21507	21512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421169
262	NC_010159	AT	3	6	21589	21594	50 %	50 %	0 %	0 %	162421169
263	NC_010159	GC	3	6	21659	21664	0 %	0 %	50 %	50 %	162421169
264	NC_010159	TAC	2	6	21678	21683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421169
265	NC_010159	CAG	2	6	21765	21770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421169
266	NC_010159	CAT	2	6	21775	21780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421169
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270	NC_010159	A	6	6	22177	22182	100 %	0 %	0 %	0 %	162418848
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292	NC_010159	CTC	2	6	23536	23541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162418335
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295	NC_010159	TGGG	2	8	23604	23611	0 %	25 %	75 %	0 %	162418335
296	NC_010159	GTG	2	6	23661	23666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418335
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382	NC_010159	CTT	2	6	30298	30303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421177
383	NC_010159	CCCGA	2	10	30374	30383	20 %	0 %	20 %	60 %	162421177
384	NC_010159	A	7	7	30456	30462	100 %	0 %	0 %	0 %	162421177
385	NC_010159	GCC	2	6	30573	30578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421177
386	NC_010159	TACCGG	2	12	30649	30660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	162421177
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391	NC_010159	TTG	3	9	30791	30799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421177
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492	NC_010159	CGT	2	6	37595	37600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419585
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